보건복지부가 지난달 발표한 국민건강보험 약가제도 개선방안은 복제약의 시장가격을 단계적으로 낮춰 일반 제약사의 매출구조를 빠르게 바꾸고 있다. 일반 복제약은 오리지널 대비 기존 약 53.55% 수준에서 45%로 조정되지만 혁신형 제약기업에는 4%포인트 우대해 49%를 4년간 부여하고 신규 등재시에는 오리지널의 60%까지 우대한다는 수치가 핵심이다. 이 때문에 종근당 JW중외제약 한국유나이티드제약과 더불어 삼진제약 등 다수 회사가 올 하반기(4분기 예상)를 목표로 혁신형 제약기업 신규 인증 준비에 나서고 있으며 법무법인에 관련 문의가 급증하고 있다.

삼진제약은 최근 제58기 정기주주총회에서 지난해 매출 3091억원과 영업이익 268억원을 보고하고 주당 800원의 현금 배당을 결정하는 등 재무 안정성을 강조했다. 경영진은 성장 축 다각화와 수익성 중심의 사업구조 재편, 핵심 R&D 역량 강화라는 중장기 전략을 제시했고 조규석 최지현 대표의 재선임과 민경훈 사외이사 선임이 승인됐다. 이 같은 내부 전략은 단순한 재무관리 차원을 넘어 혁신형 제약기업 인증을 통한 약가우대와 기술이전 기회 확보로 이어져야 주가와 밸류에이션에 실질적 영향을 줄 수 있다.

문제는 정부가 2029년 하반기부터 혁신형 인증 기준을 강화해 의약품 매출액 대비 R&D 비율을 기업 규모별로 2%포인트 올리는 등 요건 충족이 점점 까다로워진다는 점이다. 직전 3개연도 평균 매출액 1000억원 미만 기업은 R&D 비율 기준이 7%에서 9%로, 그 이상은 5%에서 7%로 상향되고 cGMP 보유 기업의 기준도 3%에서 5%로 올라가 현재 혁신형 제약기업 48곳의 문턱이 높아진다. 삼진제약은 현재 매출과 경영진의 전략을 고려할 때 R&D 지출을 어떻게 배분하느냐가 인증 획득 시점과 투자자 기대치를 결정할 핵심 변수이며 법적·행정적 이력으로 인해 즉시 신청이 어려운 경우 향후 계획 수립이 더 중요해진다. 여기에 AI 신약 개발의 상업화 가능성이 돌파구로 떠오르고 있어 인실리코 메디슨과 일라이 릴리의 4조원 규모 기술이전 사례처럼 플랫폼 효율성이나 후보물질의 경쟁력을 증명하면 기업가치 재평가의 계기가 될 수 있고 국내에서도 삼진제약을 포함한 몇몇 기업이 AI를 활용한 비만치료제 개발에 나서고 있다는 점이 주목된다.

투자자는 단기적으로는 정부 약가개편의 충격과 인증 확보 시점에 따른 실적 변동을 주시해야 하고 분기마다 발표되는 제품별 매출과 마진 변화를 예의주시할 필요가 있다. 중장기 관점에서는 R&D비중의 상승 여부와 그 비중이 향후 2029년 강화된 기준을 충족할 수 있는지, 임상 또는 전임상 파이프라인의 진전 속도, AI 파트너십 및 기술이전 계약 성사 가능성이 주가의 업사이드 요인이다. 특히 혁신형 인증은 4년간의 약가우대와 세제 및 인허가 우대 등 실익이 분명하므로 삼진제약이 실제로 언제 인증 신청을 할지와 그 결과는 투자 판단의 분기점이 된다. 결국 당장은 불확실성이 크지만 R&D 투자와 파이프라인의 실질적 진척, AI 기반 후보물질의 상업적 타당성이 확인되면 주가의 구조적 반등을 기대할 수 있을까라는 질문이 남는다.